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定量PCR诊断卡氏肺孢子虫病特异性高

 
疾病大全 --- 传染科
     据第8届国际逆转录病毒和机会感染会议文献载,美国Larson等的研究表明,定量PCR在卡氏肺孢子虫肺炎诊断中有一定作用,可以显著提高诊断的阳性预测值。

    卡氏肺孢子虫(Pc)是免疫抑制病人肺炎的重要病因。诊断卡氏肺孢子虫肺炎的金标准是呼吸道标本如诱导祛痰(IS)或支气管肺泡灌洗液(BAL)显微镜检查。分子生物学方法(例如PCR)亦被用于IS、BAL和口腔洗漱液(OW)的检查。由于分子生物学方法敏感性高,Pc DNA曾在未患卡氏肺孢子虫肺炎的病人中检测出(假阳性),这降低了该方法的临床特异性和阳性预测值。Larson等推测,定量分析或许有助于鉴别假阳性和真阳性Pc PCR检测结果,因为假阳性(定殖或携带)的拷贝数有可能比真阳性低。

    研究者建立了一种临床诊断Pc的快速、定量的实时PCR技术,该方法所需时间包括DNA提取在内不超过4小时。他们改进了以Pc多拷贝MSG基因作为目标的PCR技术,并且设计了荧光共振能转换(fluoresence resonance energy transfer,FRET)检测探针。将克隆的目标序列连续10倍稀释,作为定量标准。用另一个FRET探针检测模拟物作为内对照。病人的标本分成3份。研究者对以前做过PCR检测的56例病人的128份呼吸道标本(30份BAL,19份 IS和79份OW)进行了回顾性盲法研究。因为目的是研究定量分析的实用性,研究者故意选择假阳性率较高的标本(根据以前的PCR结果),并与随机标本比较。检查者对所有资料一无所知。所有标本至少有一张阳性涂片(IS或BAL)作为诊断依据。

    研究者提示,在评估下述结果时,应考虑选择样本的偏向(即特异性和阳性预测值比随机样本低)。结果显示,假阳性标本拷贝数有偏低倾向,这种倾向存在于所有各类样本。IS和BAL标本检测的敏感性为1.00,特异性为0.65,阳性预测值为0.62,阴性预测值为1.00。如果将10个拷贝/试管作为诊断标准,阳性预测值升至0.89而阴性预测值降至0.94。对于OW#1标本(即连续取2份口腔洗漱液标本中的第一份,共50份),敏感性为0.94,特异性为0.90,阳性预测值为0.85,阴性预测值为0.97。仍将10个拷贝/试管作为诊断标准,阳性预测值升至1.00而阴性预测值降至0.91。

    Larson等指出,还需做进一步的研究才能得到肯定结论。(中国医学网

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